Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SktA2AQ25 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SktA2AQ25 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
SktA2AQ25 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SktA2AQ25 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SktA2AQ25 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SktA2AQ25 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SktA2AQ25 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SktA2AQ25 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SktA2AQ25 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SktA2AQ25 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SktA2AQ25 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SktA2AQ25 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SktA2AQ25 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SktA2AQ25 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SktA2AQ25 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SktA2AQ25 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SktA2AQ25 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SktA2AQ25 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SktA2AQ25 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SktA2AQ25 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SktA2AQ25 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SktA2AQ25 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SktA2AQ25 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SktA2AQ25 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SktA2AQ25 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SktA2AQ25 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SktA2AQ25 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SktA2AQ25 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SktA2AQ25 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SktA2AQ25 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SktA2AQ25 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SktA2AQ25 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SktA2AQ25 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SktA2AQ25 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SktA2AQ25 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SktA2AQ25 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SktA2AQ25 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SktA2AQ25 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SktA2AQ25 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SktA2AQ25 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SktA2AQ25 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SktA2AQ25 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SktA2AQ25 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SktA2AQ25 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SktA2AQ25 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SktA2AQ25 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SktA2AQ25 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SktA2AQ25 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SktA2AQ25 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SktA2AQ25 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SktA2AQ25 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SktA2AQ25 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SktA2AQ25 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SktA2AQ25 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SktA2AQ25 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SktA2AQ25 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SktA2AQ25 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SktA2AQ25 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SktA2AQ25 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SktA2AQ25 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SktA2AQ25 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SktA2AQ25 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SktA2AQ25 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SktA2AQ25 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SktA2AQ25 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SktA2AQ25 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SktA2AQ25 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SktA2AQ25 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SktA2AQ25 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SktA2AQ25 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SktA2AQ25 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SktA2AQ25 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SktA2AQ25 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SktA2AQ25 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SktA2AQ25 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SktA2AQ25 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SktA2AQ25 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SktA2AQ25 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SktA2AQ25 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SktA2AQ25 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SktA2AQ25 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SktA2AQ25 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SktA2AQ25 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SktA2AQ25 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SktA2AQ25 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SktA2AQ25 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SktA2AQ25 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SktA2AQ25 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SktA2AQ25 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SktA2AQ25 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SktA2AQ25 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SktA2AQ25 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SktA2AQ25 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SktA2AQ25 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SktA2AQ25 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SktA2AQ25 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SktA2AQ25 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SktA2AQ25 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SktA2AQ25 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 202.4 ms