Protein–RNA interactions for Protein: A2AJW4

Ppp1r3d, Protein phosphatase 1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3dA2AJW4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppp1r3dA2AJW4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppp1r3dA2AJW4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp1r3dA2AJW4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp1r3dA2AJW4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp1r3dA2AJW4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp1r3dA2AJW4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp1r3dA2AJW4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppp1r3dA2AJW4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp1r3dA2AJW4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp1r3dA2AJW4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppp1r3dA2AJW4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ppp1r3dA2AJW4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r3dA2AJW4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r3dA2AJW4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r3dA2AJW4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r3dA2AJW4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r3dA2AJW4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ppp1r3dA2AJW4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp1r3dA2AJW4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp1r3dA2AJW4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppp1r3dA2AJW4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp1r3dA2AJW4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppp1r3dA2AJW4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r3dA2AJW4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r3dA2AJW4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppp1r3dA2AJW4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r3dA2AJW4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r3dA2AJW4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r3dA2AJW4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppp1r3dA2AJW4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r3dA2AJW4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppp1r3dA2AJW4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppp1r3dA2AJW4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp1r3dA2AJW4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppp1r3dA2AJW4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp1r3dA2AJW4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp1r3dA2AJW4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppp1r3dA2AJW4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r3dA2AJW4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r3dA2AJW4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r3dA2AJW4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r3dA2AJW4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r3dA2AJW4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r3dA2AJW4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r3dA2AJW4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp1r3dA2AJW4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r3dA2AJW4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r3dA2AJW4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r3dA2AJW4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r3dA2AJW4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r3dA2AJW4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r3dA2AJW4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r3dA2AJW4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r3dA2AJW4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r3dA2AJW4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r3dA2AJW4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r3dA2AJW4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r3dA2AJW4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ppp1r3dA2AJW4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r3dA2AJW4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ppp1r3dA2AJW4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp1r3dA2AJW4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp1r3dA2AJW4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp1r3dA2AJW4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ppp1r3dA2AJW4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ppp1r3dA2AJW4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp1r3dA2AJW4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp1r3dA2AJW4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp1r3dA2AJW4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp1r3dA2AJW4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp1r3dA2AJW4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp1r3dA2AJW4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp1r3dA2AJW4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp1r3dA2AJW4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp1r3dA2AJW4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp1r3dA2AJW4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp1r3dA2AJW4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp1r3dA2AJW4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp1r3dA2AJW4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp1r3dA2AJW4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp1r3dA2AJW4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp1r3dA2AJW4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp1r3dA2AJW4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppp1r3dA2AJW4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp1r3dA2AJW4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppp1r3dA2AJW4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp1r3dA2AJW4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp1r3dA2AJW4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppp1r3dA2AJW4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp1r3dA2AJW4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppp1r3dA2AJW4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppp1r3dA2AJW4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppp1r3dA2AJW4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ppp1r3dA2AJW4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp1r3dA2AJW4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppp1r3dA2AJW4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp1r3dA2AJW4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp1r3dA2AJW4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp1r3dA2AJW4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms