Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc163A2AGD7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc163A2AGD7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc163A2AGD7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc163A2AGD7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc163A2AGD7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc163A2AGD7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc163A2AGD7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc163A2AGD7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc163A2AGD7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc163A2AGD7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc163A2AGD7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc163A2AGD7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc163A2AGD7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc163A2AGD7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc163A2AGD7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc163A2AGD7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc163A2AGD7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc163A2AGD7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc163A2AGD7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc163A2AGD7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc163A2AGD7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc163A2AGD7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc163A2AGD7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc163A2AGD7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc163A2AGD7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc163A2AGD7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc163A2AGD7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc163A2AGD7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc163A2AGD7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc163A2AGD7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc163A2AGD7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc163A2AGD7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc163A2AGD7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc163A2AGD7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc163A2AGD7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc163A2AGD7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc163A2AGD7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc163A2AGD7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc163A2AGD7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc163A2AGD7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc163A2AGD7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc163A2AGD7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc163A2AGD7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc163A2AGD7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc163A2AGD7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc163A2AGD7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc163A2AGD7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc163A2AGD7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc163A2AGD7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc163A2AGD7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc163A2AGD7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc163A2AGD7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc163A2AGD7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc163A2AGD7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc163A2AGD7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc163A2AGD7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc163A2AGD7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc163A2AGD7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc163A2AGD7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc163A2AGD7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc163A2AGD7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc163A2AGD7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc163A2AGD7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc163A2AGD7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc163A2AGD7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc163A2AGD7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc163A2AGD7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc163A2AGD7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc163A2AGD7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc163A2AGD7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc163A2AGD7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc163A2AGD7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc163A2AGD7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc163A2AGD7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc163A2AGD7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc163A2AGD7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc163A2AGD7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc163A2AGD7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc163A2AGD7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc163A2AGD7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc163A2AGD7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc163A2AGD7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc163A2AGD7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc163A2AGD7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc163A2AGD7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc163A2AGD7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc163A2AGD7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc163A2AGD7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc163A2AGD7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc163A2AGD7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc163A2AGD7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc163A2AGD7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc163A2AGD7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc163A2AGD7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc163A2AGD7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc163A2AGD7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc163A2AGD7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc163A2AGD7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc163A2AGD7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms