Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fbf1A2A870 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Fbf1A2A870 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fbf1A2A870 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fbf1A2A870 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Fbf1A2A870 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Fbf1A2A870 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Fbf1A2A870 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fbf1A2A870 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Fbf1A2A870 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fbf1A2A870 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fbf1A2A870 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Fbf1A2A870 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Fbf1A2A870 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Fbf1A2A870 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Fbf1A2A870 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Fbf1A2A870 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Fbf1A2A870 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fbf1A2A870 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fbf1A2A870 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Fbf1A2A870 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fbf1A2A870 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fbf1A2A870 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Fbf1A2A870 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fbf1A2A870 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Fbf1A2A870 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fbf1A2A870 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Fbf1A2A870 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fbf1A2A870 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Fbf1A2A870 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fbf1A2A870 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fbf1A2A870 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fbf1A2A870 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Fbf1A2A870 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fbf1A2A870 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Fbf1A2A870 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fbf1A2A870 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Fbf1A2A870 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Fbf1A2A870 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Fbf1A2A870 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fbf1A2A870 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fbf1A2A870 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fbf1A2A870 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fbf1A2A870 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fbf1A2A870 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fbf1A2A870 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fbf1A2A870 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fbf1A2A870 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Fbf1A2A870 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Fbf1A2A870 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fbf1A2A870 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fbf1A2A870 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fbf1A2A870 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fbf1A2A870 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fbf1A2A870 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fbf1A2A870 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fbf1A2A870 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fbf1A2A870 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fbf1A2A870 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fbf1A2A870 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fbf1A2A870 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fbf1A2A870 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fbf1A2A870 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fbf1A2A870 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fbf1A2A870 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fbf1A2A870 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fbf1A2A870 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fbf1A2A870 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fbf1A2A870 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fbf1A2A870 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fbf1A2A870 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fbf1A2A870 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fbf1A2A870 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fbf1A2A870 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fbf1A2A870 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fbf1A2A870 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fbf1A2A870 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fbf1A2A870 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fbf1A2A870 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fbf1A2A870 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fbf1A2A870 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fbf1A2A870 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fbf1A2A870 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fbf1A2A870 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fbf1A2A870 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Fbf1A2A870 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fbf1A2A870 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fbf1A2A870 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fbf1A2A870 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fbf1A2A870 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fbf1A2A870 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fbf1A2A870 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fbf1A2A870 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fbf1A2A870 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fbf1A2A870 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fbf1A2A870 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fbf1A2A870 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fbf1A2A870 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fbf1A2A870 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fbf1A2A870 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms