Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cul4bA2A432 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cul4bA2A432 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cul4bA2A432 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cul4bA2A432 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cul4bA2A432 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cul4bA2A432 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cul4bA2A432 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cul4bA2A432 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cul4bA2A432 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cul4bA2A432 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cul4bA2A432 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Cul4bA2A432 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cul4bA2A432 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cul4bA2A432 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cul4bA2A432 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cul4bA2A432 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Cul4bA2A432 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cul4bA2A432 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cul4bA2A432 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cul4bA2A432 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Cul4bA2A432 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cul4bA2A432 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Cul4bA2A432 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cul4bA2A432 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cul4bA2A432 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cul4bA2A432 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cul4bA2A432 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cul4bA2A432 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cul4bA2A432 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cul4bA2A432 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cul4bA2A432 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cul4bA2A432 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cul4bA2A432 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cul4bA2A432 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cul4bA2A432 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cul4bA2A432 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cul4bA2A432 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cul4bA2A432 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cul4bA2A432 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cul4bA2A432 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Cul4bA2A432 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cul4bA2A432 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cul4bA2A432 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cul4bA2A432 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cul4bA2A432 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cul4bA2A432 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cul4bA2A432 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cul4bA2A432 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Cul4bA2A432 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cul4bA2A432 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Cul4bA2A432 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cul4bA2A432 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cul4bA2A432 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cul4bA2A432 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cul4bA2A432 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cul4bA2A432 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cul4bA2A432 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cul4bA2A432 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Cul4bA2A432 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cul4bA2A432 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cul4bA2A432 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cul4bA2A432 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Cul4bA2A432 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cul4bA2A432 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cul4bA2A432 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cul4bA2A432 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cul4bA2A432 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cul4bA2A432 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cul4bA2A432 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cul4bA2A432 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cul4bA2A432 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cul4bA2A432 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cul4bA2A432 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cul4bA2A432 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cul4bA2A432 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Cul4bA2A432 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cul4bA2A432 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cul4bA2A432 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cul4bA2A432 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cul4bA2A432 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cul4bA2A432 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cul4bA2A432 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cul4bA2A432 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cul4bA2A432 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cul4bA2A432 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cul4bA2A432 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cul4bA2A432 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cul4bA2A432 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cul4bA2A432 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cul4bA2A432 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cul4bA2A432 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cul4bA2A432 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cul4bA2A432 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cul4bA2A432 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cul4bA2A432 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cul4bA2A432 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cul4bA2A432 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cul4bA2A432 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Cul4bA2A432 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms