Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fam71e1A1L3C1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fam71e1A1L3C1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Fam71e1A1L3C1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Fam71e1A1L3C1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Fam71e1A1L3C1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Fam71e1A1L3C1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Fam71e1A1L3C1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Fam71e1A1L3C1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Fam71e1A1L3C1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Fam71e1A1L3C1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Fam71e1A1L3C1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Fam71e1A1L3C1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Fam71e1A1L3C1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Fam71e1A1L3C1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Fam71e1A1L3C1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Fam71e1A1L3C1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Fam71e1A1L3C1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Fam71e1A1L3C1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Fam71e1A1L3C1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Fam71e1A1L3C1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Fam71e1A1L3C1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Fam71e1A1L3C1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Fam71e1A1L3C1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Fam71e1A1L3C1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Fam71e1A1L3C1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Fam71e1A1L3C1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Fam71e1A1L3C1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Fam71e1A1L3C1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Fam71e1A1L3C1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Fam71e1A1L3C1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Fam71e1A1L3C1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Fam71e1A1L3C1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Fam71e1A1L3C1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Fam71e1A1L3C1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Fam71e1A1L3C1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Fam71e1A1L3C1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Fam71e1A1L3C1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Fam71e1A1L3C1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Fam71e1A1L3C1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Fam71e1A1L3C1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Fam71e1A1L3C1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Fam71e1A1L3C1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Fam71e1A1L3C1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Fam71e1A1L3C1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Fam71e1A1L3C1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Fam71e1A1L3C1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Fam71e1A1L3C1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fam71e1A1L3C1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Fam71e1A1L3C1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Fam71e1A1L3C1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Fam71e1A1L3C1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Fam71e1A1L3C1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Fam71e1A1L3C1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Fam71e1A1L3C1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Fam71e1A1L3C1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Fam71e1A1L3C1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Fam71e1A1L3C1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Fam71e1A1L3C1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Fam71e1A1L3C1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Fam71e1A1L3C1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Fam71e1A1L3C1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Fam71e1A1L3C1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Fam71e1A1L3C1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Fam71e1A1L3C1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Fam71e1A1L3C1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Fam71e1A1L3C1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Fam71e1A1L3C1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Fam71e1A1L3C1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Fam71e1A1L3C1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Fam71e1A1L3C1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Fam71e1A1L3C1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Fam71e1A1L3C1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Fam71e1A1L3C1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Fam71e1A1L3C1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Fam71e1A1L3C1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Fam71e1A1L3C1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Fam71e1A1L3C1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Fam71e1A1L3C1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Fam71e1A1L3C1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Fam71e1A1L3C1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Fam71e1A1L3C1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Fam71e1A1L3C1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Fam71e1A1L3C1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Fam71e1A1L3C1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Fam71e1A1L3C1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Fam71e1A1L3C1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Fam71e1A1L3C1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Fam71e1A1L3C1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Fam71e1A1L3C1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Fam71e1A1L3C1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Fam71e1A1L3C1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Fam71e1A1L3C1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Fam71e1A1L3C1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Fam71e1A1L3C1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Fam71e1A1L3C1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Fam71e1A1L3C1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Fam71e1A1L3C1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Fam71e1A1L3C1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Fam71e1A1L3C1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms