Protein–RNA interactions for Protein: A1A546

Isx, Intestine-specific homeobox, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IsxA1A546 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IsxA1A546 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IsxA1A546 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IsxA1A546 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IsxA1A546 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IsxA1A546 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IsxA1A546 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IsxA1A546 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IsxA1A546 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IsxA1A546 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IsxA1A546 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IsxA1A546 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IsxA1A546 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IsxA1A546 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IsxA1A546 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IsxA1A546 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IsxA1A546 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IsxA1A546 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IsxA1A546 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IsxA1A546 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IsxA1A546 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IsxA1A546 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IsxA1A546 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IsxA1A546 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IsxA1A546 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IsxA1A546 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IsxA1A546 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IsxA1A546 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IsxA1A546 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IsxA1A546 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IsxA1A546 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IsxA1A546 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IsxA1A546 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IsxA1A546 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IsxA1A546 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IsxA1A546 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IsxA1A546 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IsxA1A546 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IsxA1A546 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IsxA1A546 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IsxA1A546 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IsxA1A546 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IsxA1A546 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IsxA1A546 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IsxA1A546 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IsxA1A546 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IsxA1A546 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IsxA1A546 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IsxA1A546 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IsxA1A546 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IsxA1A546 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IsxA1A546 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IsxA1A546 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IsxA1A546 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IsxA1A546 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IsxA1A546 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IsxA1A546 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IsxA1A546 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IsxA1A546 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IsxA1A546 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IsxA1A546 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IsxA1A546 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IsxA1A546 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IsxA1A546 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IsxA1A546 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IsxA1A546 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IsxA1A546 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IsxA1A546 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IsxA1A546 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IsxA1A546 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IsxA1A546 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IsxA1A546 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
IsxA1A546 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IsxA1A546 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IsxA1A546 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IsxA1A546 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IsxA1A546 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IsxA1A546 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IsxA1A546 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IsxA1A546 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IsxA1A546 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IsxA1A546 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IsxA1A546 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IsxA1A546 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IsxA1A546 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IsxA1A546 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IsxA1A546 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IsxA1A546 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IsxA1A546 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IsxA1A546 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IsxA1A546 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IsxA1A546 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IsxA1A546 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IsxA1A546 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IsxA1A546 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IsxA1A546 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IsxA1A546 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IsxA1A546 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IsxA1A546 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IsxA1A546 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms