Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDM2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A286YDM2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
A0A286YDM2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A286YDM2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A286YDM2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A286YDM2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A286YDM2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
A0A286YDM2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A286YDM2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A286YDM2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A286YDM2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A286YDM2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A286YDM2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A286YDM2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A286YDM2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A286YDM2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A286YDM2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A286YDM2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A286YDM2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A286YDM2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A286YDM2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A286YDM2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A286YDM2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A286YDM2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A286YDM2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A286YDM2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A286YDM2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A286YDM2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A286YDM2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A286YDM2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A286YDM2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A286YDM2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A286YDM2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A286YDM2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A286YDM2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A286YDM2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A286YDM2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A286YDM2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A286YDM2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A286YDM2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A286YDM2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A286YDM2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A286YDM2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A286YDM2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A286YDM2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A286YDM2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A286YDM2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A286YDM2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A286YDM2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A286YDM2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A286YDM2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A286YDM2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A286YDM2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A286YDM2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A286YDM2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A286YDM2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A286YDM2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A286YDM2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A286YDM2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A286YDM2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
A0A286YDM2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A286YDM2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A286YDM2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A286YDM2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A286YDM2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A286YDM2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A286YDM2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A286YDM2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A286YDM2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A286YDM2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A286YDM2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A286YDM2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A286YDM2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A286YDM2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A286YDM2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
A0A286YDM2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A286YDM2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
A0A286YDM2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A286YDM2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
A0A286YDM2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A286YDM2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A286YDM2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A286YDM2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
A0A286YDM2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A286YDM2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
A0A286YDM2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A286YDM2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A286YDM2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A286YDM2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A286YDM2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
A0A286YDM2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A286YDM2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A286YDM2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A286YDM2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
A0A286YDM2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A286YDM2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A286YDM2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
A0A286YDM2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A286YDM2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
A0A286YDM2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
A0A286YDM2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms