Protein–RNA interactions for Protein: A0A1L1SQF0

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1L1SQF0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
A0A1L1SQF0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
A0A1L1SQF0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
A0A1L1SQF0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
A0A1L1SQF0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
A0A1L1SQF0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
A0A1L1SQF0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
A0A1L1SQF0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
A0A1L1SQF0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
A0A1L1SQF0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
A0A1L1SQF0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
A0A1L1SQF0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
A0A1L1SQF0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
A0A1L1SQF0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
A0A1L1SQF0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
A0A1L1SQF0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
A0A1L1SQF0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
A0A1L1SQF0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
A0A1L1SQF0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
A0A1L1SQF0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
A0A1L1SQF0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
A0A1L1SQF0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
A0A1L1SQF0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
A0A1L1SQF0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
A0A1L1SQF0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
A0A1L1SQF0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
A0A1L1SQF0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
A0A1L1SQF0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
A0A1L1SQF0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
A0A1L1SQF0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
A0A1L1SQF0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
A0A1L1SQF0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
A0A1L1SQF0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
A0A1L1SQF0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A1L1SQF0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A1L1SQF0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
A0A1L1SQF0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
A0A1L1SQF0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
A0A1L1SQF0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
A0A1L1SQF0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
A0A1L1SQF0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
A0A1L1SQF0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
A0A1L1SQF0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
A0A1L1SQF0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
A0A1L1SQF0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A1L1SQF0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A1L1SQF0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A1L1SQF0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A1L1SQF0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A1L1SQF0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A1L1SQF0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A1L1SQF0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A1L1SQF0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A1L1SQF0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A1L1SQF0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A1L1SQF0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A1L1SQF0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A1L1SQF0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A1L1SQF0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A1L1SQF0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A1L1SQF0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A1L1SQF0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A1L1SQF0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A1L1SQF0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A1L1SQF0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A1L1SQF0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
A0A1L1SQF0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28■■■□□ 2.07
A0A1L1SQF0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
A0A1L1SQF0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A1L1SQF0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A1L1SQF0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
A0A1L1SQF0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
A0A1L1SQF0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
A0A1L1SQF0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A1L1SQF0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A1L1SQF0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A1L1SQF0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A1L1SQF0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A1L1SQF0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
A0A1L1SQF0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
A0A1L1SQF0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
A0A1L1SQF0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
A0A1L1SQF0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A1L1SQF0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A1L1SQF0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A1L1SQF0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A1L1SQF0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A1L1SQF0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
A0A1L1SQF0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
A0A1L1SQF0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
A0A1L1SQF0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A1L1SQF0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A1L1SQF0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A1L1SQF0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A1L1SQF0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A1L1SQF0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A1L1SQF0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A1L1SQF0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A1L1SQF0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A1L1SQF0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms