Protein–RNA interactions for Protein: A0A0M3U1B0

Sycp2l, Synaptonemal complex protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sycp2lA0A0M3U1B0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sycp2lA0A0M3U1B0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sycp2lA0A0M3U1B0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sycp2lA0A0M3U1B0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sycp2lA0A0M3U1B0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Sycp2lA0A0M3U1B0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sycp2lA0A0M3U1B0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sycp2lA0A0M3U1B0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sycp2lA0A0M3U1B0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sycp2lA0A0M3U1B0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sycp2lA0A0M3U1B0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sycp2lA0A0M3U1B0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sycp2lA0A0M3U1B0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sycp2lA0A0M3U1B0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sycp2lA0A0M3U1B0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sycp2lA0A0M3U1B0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sycp2lA0A0M3U1B0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sycp2lA0A0M3U1B0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms