Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYP6

Sirpb1a, Signal-regulatory protein beta 1A, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sirpb1aA0A0A6YYP6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sirpb1aA0A0A6YYP6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sirpb1aA0A0A6YYP6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sirpb1aA0A0A6YYP6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sirpb1aA0A0A6YYP6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sirpb1aA0A0A6YYP6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sirpb1aA0A0A6YYP6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
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