Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQI7

B020011L13Rik, RIKEN cDNA B020011L13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020011L13RikA0A087WQI7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
B020011L13RikA0A087WQI7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
B020011L13RikA0A087WQI7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
B020011L13RikA0A087WQI7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
B020011L13RikA0A087WQI7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
B020011L13RikA0A087WQI7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
B020011L13RikA0A087WQI7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
B020011L13RikA0A087WQI7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
B020011L13RikA0A087WQI7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
B020011L13RikA0A087WQI7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
B020011L13RikA0A087WQI7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
B020011L13RikA0A087WQI7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
B020011L13RikA0A087WQI7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
B020011L13RikA0A087WQI7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
B020011L13RikA0A087WQI7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
B020011L13RikA0A087WQI7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
B020011L13RikA0A087WQI7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
B020011L13RikA0A087WQI7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
B020011L13RikA0A087WQI7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
B020011L13RikA0A087WQI7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
B020011L13RikA0A087WQI7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
B020011L13RikA0A087WQI7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
B020011L13RikA0A087WQI7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
B020011L13RikA0A087WQI7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
B020011L13RikA0A087WQI7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
B020011L13RikA0A087WQI7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
B020011L13RikA0A087WQI7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B020011L13RikA0A087WQI7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
B020011L13RikA0A087WQI7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
B020011L13RikA0A087WQI7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
B020011L13RikA0A087WQI7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
B020011L13RikA0A087WQI7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B020011L13RikA0A087WQI7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
B020011L13RikA0A087WQI7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B020011L13RikA0A087WQI7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
B020011L13RikA0A087WQI7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B020011L13RikA0A087WQI7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B020011L13RikA0A087WQI7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B020011L13RikA0A087WQI7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B020011L13RikA0A087WQI7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
B020011L13RikA0A087WQI7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B020011L13RikA0A087WQI7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B020011L13RikA0A087WQI7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
B020011L13RikA0A087WQI7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B020011L13RikA0A087WQI7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B020011L13RikA0A087WQI7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B020011L13RikA0A087WQI7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
B020011L13RikA0A087WQI7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
B020011L13RikA0A087WQI7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B020011L13RikA0A087WQI7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B020011L13RikA0A087WQI7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B020011L13RikA0A087WQI7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
B020011L13RikA0A087WQI7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
B020011L13RikA0A087WQI7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
B020011L13RikA0A087WQI7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
B020011L13RikA0A087WQI7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
B020011L13RikA0A087WQI7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
B020011L13RikA0A087WQI7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
B020011L13RikA0A087WQI7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
B020011L13RikA0A087WQI7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
B020011L13RikA0A087WQI7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
B020011L13RikA0A087WQI7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
B020011L13RikA0A087WQI7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
B020011L13RikA0A087WQI7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
B020011L13RikA0A087WQI7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
B020011L13RikA0A087WQI7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
B020011L13RikA0A087WQI7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B020011L13RikA0A087WQI7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
B020011L13RikA0A087WQI7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B020011L13RikA0A087WQI7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
B020011L13RikA0A087WQI7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
B020011L13RikA0A087WQI7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
B020011L13RikA0A087WQI7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
B020011L13RikA0A087WQI7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
B020011L13RikA0A087WQI7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
B020011L13RikA0A087WQI7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
B020011L13RikA0A087WQI7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
B020011L13RikA0A087WQI7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
B020011L13RikA0A087WQI7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
B020011L13RikA0A087WQI7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms