Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Knop1Q9Z2Q2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Knop1Q9Z2Q2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms