Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ddx20Q9JJY4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddx20Q9JJY4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ddx20Q9JJY4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
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