Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4bQ9ES61 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a4bQ9ES61 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.5 ms