Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Irx6Q9ER75 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms