Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tlr1Q9EPQ1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms