Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tspan11Q9D1D1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tspan11Q9D1D1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms