Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tsnaxip1Q99P25 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms