Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.2■□□□□ 0.83
TriobpQ99KW3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms