Protein–RNA interactions for Protein: Q923P0

Col20a1, Collagen alpha-1(XX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col20a1Q923P0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Col20a1Q923P0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col20a1Q923P0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms