Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU1

Yipf1, Protein YIPF1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf1Q91VU1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Yipf1Q91VU1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Yipf1Q91VU1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Yipf1Q91VU1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Yipf1Q91VU1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Yipf1Q91VU1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Yipf1Q91VU1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Yipf1Q91VU1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Yipf1Q91VU1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Yipf1Q91VU1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Yipf1Q91VU1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Yipf1Q91VU1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Yipf1Q91VU1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Yipf1Q91VU1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Yipf1Q91VU1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms