Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cabp4Q8VHC5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms