Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shtn1Q8K2Q9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shtn1Q8K2Q9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Shtn1Q8K2Q9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Shtn1Q8K2Q9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Shtn1Q8K2Q9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shtn1Q8K2Q9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shtn1Q8K2Q9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shtn1Q8K2Q9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shtn1Q8K2Q9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shtn1Q8K2Q9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shtn1Q8K2Q9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shtn1Q8K2Q9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shtn1Q8K2Q9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shtn1Q8K2Q9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shtn1Q8K2Q9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shtn1Q8K2Q9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shtn1Q8K2Q9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shtn1Q8K2Q9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shtn1Q8K2Q9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms