Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Knl1Q66JQ7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Knl1Q66JQ7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Knl1Q66JQ7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms