Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxd1Q61345 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Foxd1Q61345 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms