Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Mre11Q61216 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mre11Q61216 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms