Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
9930111J21Rik1Q5SVP0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
9930111J21Rik1Q5SVP0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
9930111J21Rik1Q5SVP0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
9930111J21Rik1Q5SVP0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms