Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CiartQ3TQ03 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CiartQ3TQ03 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms