Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah2Q06986 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Siah2Q06986 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms