Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sox12Q04890 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sox12Q04890 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms