Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defb1P56386 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defb1P56386 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defb1P56386 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defb1P56386 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defb1P56386 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defb1P56386 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defb1P56386 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defb1P56386 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Defb1P56386 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Defb1P56386 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms