Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkn1bP46414 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms