Protein–RNA interactions for Protein: P43137

Reg1, Lithostathine-1, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reg1P43137 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reg1P43137 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reg1P43137 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reg1P43137 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reg1P43137 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reg1P43137 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reg1P43137 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reg1P43137 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reg1P43137 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reg1P43137 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reg1P43137 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reg1P43137 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reg1P43137 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reg1P43137 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reg1P43137 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reg1P43137 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reg1P43137 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reg1P43137 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reg1P43137 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reg1P43137 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reg1P43137 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reg1P43137 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Reg1P43137 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Reg1P43137 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Reg1P43137 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Reg1P43137 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reg1P43137 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reg1P43137 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms