Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cnga1P29974 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cnga1P29974 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms