Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kif3aP28741 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms