Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stx8O88983 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx8O88983 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx8O88983 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx8O88983 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx8O88983 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx8O88983 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx8O88983 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx8O88983 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx8O88983 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stx8O88983 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx8O88983 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx8O88983 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Stx8O88983 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms