Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Psmb10O35955 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psmb10O35955 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms