Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Srsf5O35326 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Srsf5O35326 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms