Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rfx7F8VPJ6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rfx7F8VPJ6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rfx7F8VPJ6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms