Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Trappc8E9PWG2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trappc8E9PWG2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trappc8E9PWG2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms