Protein–RNA interactions for Protein: E0CX42

Gm4491, Predicted gene 4491, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4491E0CX42 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm4491E0CX42 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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