Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G7

Trbv1, T cell receptor beta, variable 1 (Fragment), mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv1A0A0B4J1G7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv1A0A0B4J1G7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv1A0A0B4J1G7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv1A0A0B4J1G7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trbv1A0A0B4J1G7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv1A0A0B4J1G7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv1A0A0B4J1G7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trbv1A0A0B4J1G7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv1A0A0B4J1G7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv1A0A0B4J1G7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv1A0A0B4J1G7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Trbv1A0A0B4J1G7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv1A0A0B4J1G7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv1A0A0B4J1G7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv1A0A0B4J1G7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv1A0A0B4J1G7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv1A0A0B4J1G7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Trbv1A0A0B4J1G7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trbv1A0A0B4J1G7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv1A0A0B4J1G7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trbv1A0A0B4J1G7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trbv1A0A0B4J1G7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trbv1A0A0B4J1G7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trbv1A0A0B4J1G7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Trbv1A0A0B4J1G7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv1A0A0B4J1G7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv1A0A0B4J1G7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Trbv1A0A0B4J1G7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Trbv1A0A0B4J1G7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv1A0A0B4J1G7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv1A0A0B4J1G7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Trbv1A0A0B4J1G7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trbv1A0A0B4J1G7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trbv1A0A0B4J1G7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trbv1A0A0B4J1G7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv1A0A0B4J1G7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Trbv1A0A0B4J1G7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv1A0A0B4J1G7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Trbv1A0A0B4J1G7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv1A0A0B4J1G7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv1A0A0B4J1G7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv1A0A0B4J1G7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv1A0A0B4J1G7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv1A0A0B4J1G7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Trbv1A0A0B4J1G7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv1A0A0B4J1G7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv1A0A0B4J1G7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv1A0A0B4J1G7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv1A0A0B4J1G7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv1A0A0B4J1G7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv1A0A0B4J1G7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv1A0A0B4J1G7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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