Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syt6Q9R0N8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syt6Q9R0N8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms