Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Sh3bgrlQ9JJU8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sh3bgrlQ9JJU8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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