Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SgshQ9EQ08 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SgshQ9EQ08 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms