Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Xab2Q9DCD2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Xab2Q9DCD2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms