Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc3Q9D6Y1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc3Q9D6Y1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms