Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH2

Pard3, Partitioning defective 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3Q99NH2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pard3Q99NH2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pard3Q99NH2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pard3Q99NH2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pard3Q99NH2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pard3Q99NH2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pard3Q99NH2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pard3Q99NH2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms