Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl27Q99N92 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl27Q99N92 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl27Q99N92 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl27Q99N92 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl27Q99N92 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl27Q99N92 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl27Q99N92 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl27Q99N92 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl27Q99N92 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl27Q99N92 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl27Q99N92 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl27Q99N92 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl27Q99N92 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl27Q99N92 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl27Q99N92 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl27Q99N92 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl27Q99N92 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl27Q99N92 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl27Q99N92 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl27Q99N92 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl27Q99N92 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl27Q99N92 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl27Q99N92 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl27Q99N92 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl27Q99N92 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl27Q99N92 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl27Q99N92 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl27Q99N92 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl27Q99N92 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl27Q99N92 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl27Q99N92 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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